Des inventaires portant sur certains groupes de la flore et de la faune du département ont été publiés dans la 2ème moitié du XIX siècle. Depuis, d'autres travaux ont permis d'évaluer l'évolution de ce patrimoine naturel, mais l'estimation du nombre d'espèces en Eure-et-Loir ne peut être complète car aucune étude exhaustive n'a été réalisée, et certains groupes n'ont jamais été étudiés.

Nous n'avons donc encore qu'une connaissance très partielle du patrimoine naturel.