Le Département d'Eure-et-Loir compte 1 180 km de cours d'eau, dont 850 km permanents répartis entre le bassin de la Seine au nord (l'Eure et ses affluents) et celui de la Loire au sud (l'Huisne, le Loir et leurs affluents).

Dans l'ensemble, il s'agit de rivières de plaine de type méandriforme, caractérisées par une pente relativement faible (< 0,3 %), et par la présence de nombreux anciens moulins (~ 400).

Etant donné qu'elles constituent en majorité l'amont des bassins versants de l'Eure et du Loir, elles sont d'assez faible gabarit et ont des débits peu importants. Cette caractéristique les rend particulièrement sensibles à toute forme de pollution et de dégradation.

Elles sont principalement alimentées par les nappes souterraines (nappes de la craie, des sables du Perche, et des calcaires de Beauce).